上海航交所運價指數主要包括中國出口集裝箱運價指數、上海出口集裝箱運價指數、中國沿海（散貨）運價指數、中國沿海煤炭運價指數、中國進口干散貨運價指數、中國進口原油運價指數、中國進口集裝箱運價指數和臺灣海峽兩岸間集裝箱運價指數等各類運價指數。

上海航運交易所已經形成的“上海航運指數”系列，最早起步于1998年，當時發布了中國出口集裝箱運價指數（CCFI）——全球比較早的集裝箱運價指數。

而“上海出口集裝箱運價指數”（SCFI）則誕生于2009年，彼時是為了運價衍生品（遠期運費交易）而專門開發的?！癈”代表中國、“S”代表上海。2010年1月，在英國倫敦成交了首筆以SCFI為依據的集裝箱遠期運費掉期合同。

事實上，“上海出口集裝箱指數”早已擁有全球影響力。“2013年8月，美國聯邦海事委員會（FMC）修改運價備案審批條款，同意以指數掛鉤合約來接收運價備案?！睆堩摻榻B。也正因為此，“上海出口集裝箱運價指數”成為了美國聯邦海事委員會（FMC）的指數掛鉤運價備案的主要標的。

2016年，上海航運交易所的航運指數得到了法律固化，上海市制訂并頒布《上海市推進國際航運中心建設條例》，這是中國較早的地方性航運法規。《上海市推進國際航運中心建設條例》直接把“上海航運交易所開發運價指數”寫入法條，法律的固化非常重要，從此上海航運交易所可以在法律的框架下，以合法的身份開展指數的研發工作，也為確保指數的真實性奠定法律基礎。

2017年，“上海航運指數SHSI”已經成功注冊商標，名稱里的“上?！辈粌H僅局限于上海相關的航線，而是“在上海發布”的意思。而“上海航運指數”是一個指數體系的概念，從1998年到2020年，上海航運交易所已經發布了21大類，覆蓋集裝箱、散貨、買賣船、船員薪酬、“一帶一路”等多個領域，體現出我國高端航運服務業迅速發展的勢頭。

2018年，國家統計局開展了《航交所運價指數與波羅的海交易所BDI指數比較研究》。據悉，課題認為上海航運交易所運價指數已經成為中國航運界認可度較高的市場“晴雨表”，與中國經貿指標的相關度優于BDI指數。