大額存單存在交易門檻較高，流動性較低，發行數量有限和收益降低的弊端。大額存單相應的收益狀況會比普通存款較高，在整體上會出現一定的弊端，是需要慎重考慮進行購買的。

大額存單具有較高的交易門檻。通常最低門檻是20萬元起步，它會根據不同銀行的相應規則設定來改變。因此用戶們在選擇進行交易，存大額存單時，需要先咨詢其存款門檻，以便順利進行存款操作。其實就是整體大額存單的流動性相對較低，這主要是由于大額存單作為一個定期存款產品，自身是具有相應期限的，如果提前支取是會按照相應活期存款利息進行計算的。

大額存單的發行數量是具有一定限制的，在發行之前需要向中國人民銀行進行報備，發行計劃才可以完成上市。雖然整體大額存單的利息相對其他存款產品來說較高，但現在由于政策等相應的原因，調整整體的利率和收益情況有所降低。